Aide application SHIBA

1 SHIBA

Un Package R combinant Shiny et STAN pour faciliter la réalisation des analyses statistiques Bayésiennes. Il est basé sur une architecture golem .

SHIBA (Shiny Bayesian Analysis) est une application créée par les membres du Groupe Méthodes en Recherche Clinique (GMRC) des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg et de l’équipe IMAGES – RaDoScauba du laboratoire iCUBE (CNRS UMR 7357) Université de Strasbourg.

SHIBA est une interface graphique permettant de réaliser des analyses bayésiennes via le logiciel de statistiques R et les packages associés sans avoir à coder les instructions nécessaires pour obtenir ces analyses.

Cet outil est proposé sans aucune garantie de validité sur les résultats.

Ce logiciel est mis à votre disposition gracieusement par les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS) et l’Université de Strasbourg (Unistra). Ni les HUS ni l’Unistra ne pourront pas être tenus pour responsables des résultats produits par l’outil ainsi que de ses mésusages. Afin de se conformer à la règlementation nationale et européenne sur la protection des données à caractère personnel, nous vous demandons de n’utiliser que des données anonymisées.

1.1 Installation

Pour installer l’application, il suffit de taper les instructions suivantes, en utilisant la dernière version en date de R.

remotes::install_github("https://github.com/GMRC-HUS/ShiBA")

1.2 Démarrage de l’application

Pour lancer l’application, exécuter l’instruction suivante :

ShiBA::run_app(options = list(launch.browser = TRUE))

1.3 Fonctionnement général de SHIBA

SHIBA dispose de plusieurs onglets. Une fois la base de données importée et ouverte dans SHIBA, vous pourrez choisir l’onglet correspondant aux analyses à réaliser : description des données puis inférence, uni- ou multivariée. Dans chaque onglet, en cliquant sur le bouton « AIDE et détails » vous accéderez à une aide spécifique de l’onglet.

1.4 License

L’ensemble du contenu de la documentation est mis à disposition sous licence CC-by-nc 4.0.

La licence CC-by-nc 4.0 permet toute exploitation de l’œuvre (partager, copier, reproduire, distribuer, communiquer, réutiliser, adapter) par tous moyens, sous tous formats et sous toutes licences. Toutes les exploitations de l’œuvre ou des œuvres dérivées, sauf à des fins commerciales, sont possibles.

Les obligations liées à la licence sont de :

• créditer les créateurs de la paternité des œuvres originales, d’en indiquer les sources et d’indiquer si des modifications ont été effectuées aux œuvres (obligation d’attribution) ;

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